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上海信帆生物:T細胞受體測序(TCR seq)

更新時間:2016-04-13      瀏覽次數(shù):1651

T細胞受體(T cell receptor,TCR)是T細胞表面特異性識別抗原和介導免疫應答的分子,是人類基因組中多態(tài)性zui高的區(qū)域之一,決定著人的免疫系統(tǒng)如何適應環(huán)境的變化。T細胞受體庫的多樣性(包括基因重組以及選擇性表達)直接反映了機體免疫應答的狀態(tài)。

TCR可分為TCRα/β和TCRγ/δ兩種類型, 外周血T細胞主要為TCRα/β的T細胞, 是介導機體特異性細胞免疫反應的主要細胞。如圖1所示:TCRβ基因由可變區(qū)(V)、多變區(qū)(D)、結(jié)合區(qū)(J)和恒定區(qū)(C)四部分基因片段組成,形成互補決定區(qū)(complementarities determining region, CDR)和間隔的4個骨架區(qū)(framework region, FR)。

在T細胞發(fā)育過程中CDR1,2和FR區(qū)域相對保守,CDR3區(qū)由V、 D和J 進行重排(如圖2所示)而形成具有功能的TCR編碼基因(T細胞克隆),由于V (65-100種)、D (2種)、J (13種)基因片段本身具有多樣性,此外,由于在重排的過程中,在VD及D-J的連接區(qū)經(jīng)常有非模板的核苷酸的隨機插入或刪除,進一步增加了CDR3區(qū)的多樣性(連接形成的多樣性約為2 × 1011)。這種基因片段連接的不準確性使TCR的表達呈多樣性, 以識別各種不同的抗原。正常個體在無抗原刺激時,TCR基因重排是隨機的,因此正常人外周T細胞呈多家族、多克隆性特點。不同抗原(腫瘤、疫苗、病院微生物或者移植物等)刺激后,TCR V區(qū)基因可對該\抗原產(chǎn)生特異性識別,并使帶有這類基因的 T細胞得到優(yōu)勢擴增,可用于分析不同 TCR V亞家族 T細胞的表達和利用。

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